नेपाल प्रज्ञा–प्रतिष्ठानको मिति २०७९ फागुन ८ गते बसेको प्राज्ञ परिषद्को पहिलो बैठकद्वारा प्रज्ञा–प्रतिष्ठान अन्तर्गत क्रियाशील प्राज्ञिक विभागहरू देहायअनुसार गठन गरिएको छः

नेपाल प्रज्ञा–प्रतिष्ठानलाई सल्लाह सुझाब र विज्ञता प्रदान गर्नका लागि अन्तर्गतका विभागहरूमा निम्नानुसार प्रमुख, सदस्य र सल्लाहकार रहने गरी विभागीय समितिहरू गठन गरिएको छ ।

क)    भाषा (नेपाली भाषा, कोश र  व्याकरण) विभाग

ख)    संस्कृति विभाग

ग)    दर्शनशास्त्र विभाग

घ)    सामाजिक शास्त्र विभाग

ङ)    भाषा (मातृभाषा, कोश र व्याकरण) विभाग